Το λημματολόγιο στο "Παπυράκι" δομείται με βάση την αυστηρά αλφαβητική λημματογράφηση, έτσι ώστε να είναι εύκολο στον αναγνώστη να αναζητήσει την οποιαδήποτε λέξη με βάση το αρχικό της γράμμα. Σε ό,τι αφορά το καθαρά "γλωσσικό" μέρος του λεξικού, επιδίωξη ήταν να μην παραλειφθούν λέξεις καθιερωμένες από τη χρήση, να αποτυπωθεί όλος ο πλούτος της "ζωντανής" ελληνικής γλώσσας σε όλα τα επίπεδα έκφρασης.